Dalam Sistem Kurikulum Mayor Minor yang diterapkan di Institut Pertanian Bogor sejak tahun 2005, maka di Fakultas Teknologi Pertanian IPB dibentuk 4 program Mayor untuk mahasiswa tingkat Sarjana (S-1). Adapun ke-4 mayor tersebut antara lain adalah:
- Departemen Teknik Mesin dan Biosistem
- Departemen Ilmu dan Teknologi Pangan
- Departemen Teknologi Industri Pertanian
- Departemen Teknik Sipil dan Lingkungan
Pendidikan Program Sarjana di Fakultas Teknologi Pertanian IPB diselenggarakan dengan masa studi normal yakni 4 (empat) tahun dengan sks minimum 144 SKS. dengan diterapkannya sistem kurikulum Mayor-Minor di Faperta IPB, mahasiswa akan memiliki kompetensi yang lebih luas dengan mengambil minor atau mata kuliah supporting course di lingkungan IPB (tidak harus dalam satu Fakultas)